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Probe Design Service

Custom qPCR and dPCR Probes
 
 

Augmentez la sensibilité et la spécificité de votre PCR en temps réel ou numérique avec les sondes de Microsynth. Des sondes qPCR et dPCR de haute qualité avec une large gamme de colorants et de quenchers sont livrées à une vitesse exceptionnelle.

 

Conceptions peu complexes

 
Conceptions peu complexes

Les tests à sonde doublement marquée sont les plus courants dans le domaine de la PCR en temps réel. Les tests à sonde doublement marquée sont généralement plus spécifiques que les tests SYBR Green. La mise en place d'un test basé sur des sondes nécessite également moins d'étapes d'optimisation et les résultats de l'analyse sont plus faciles à interpréter. En utilisant des sondes bien conçues et de haute qualité dans votre analyse, vous réduisez le coût de l'optimisation de l'essai et les éventuelles corrections d'erreurs et répétitions de vos mesures par rapport aux essais SYBRGreen, ce qui rend votre analyse plus rapide et plus rentable.

Grâce à la disponibilité de plusieurs outils logiciels gratuits en ligne, une bonne conception d'essai pour un essai singleplex impliquant une sonde doublement marquée (également appelée hydrolyse ou sonde TaqMan) est facile à réaliser et ne nécessite pas de connaissances approfondies (il suffit de garder à l'esprit les principales lignes directrices de conception suivantes).

Microsynth peut recommander les outils de conception suivants qui facilitent la conception d'amorces hautement personnalisées et de sondes doublement marquées pour les applications qPCR de routine :

  • Primer-BLAST

    Primer-BLAST a été développé au NCBI pour aider les utilisateurs à créer des amorces spécifiques à la cible PCR visée. Il utilise Primer3 pour concevoir des amorces PCR, puis utilise BLAST et l'algorithme d'alignement global pour comparer les amorces à la base de données sélectionnée par l'utilisateur afin d'éviter les paires d'amorces (toutes les combinaisons, y compris les paires d'amorces avant-arrière, avant-avant ainsi que les paires arrière-arrière) qui peuvent provoquer des amplifications non spécifiques. Ye J, Coulouris G, Zaretskaya I, Cutcutache I, Rozen S, Madden T (2012). Primer-BLAST : un outil pour concevoir des amorces spécifiques pour la réaction en chaîne par polymérase. BMC Bioinformatics. 13:134.

  • Primer3Plus

    Steve Rozen et Helen J. Skaletsky (2000) Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers. In : Krawetz S, Misener S (eds) Bioinformatics Methods and Protocols : Methods in Molecular Biology. Humana Press, Totowa, NJ, pp 365-386

 

 

Conceptions plus complexes


Conceptions plus complexes (sur demande)

Lors de la planification d'expériences nécessitant des considérations de conception d'essais plus complexes, telles que des conceptions spécifiques d'épissage, de multiplexage, de SNP et de CNV, ou une chimie spéciale (LNA/MGB/Propynyl), vous pouvez compter sur l'expérience de Microsynth dans ce domaine (>2 décennies) ainsi que sur des outils de conception professionnels sélectionnés pour des applications aussi exigeantes.
Si vous avez besoin d'une assistance supplémentaire pour la conception d'amorces et de sondes, contactez-nous à myproject@microsynth.ch. N'oubliez pas de préciser les éléments suivants :

  • Objectif expérimental (analyse d'expression, détection d'un pathogène, etc.)
  • Le(s) numéro(s) d'accession ou alternativement les séquences génétiques de votre cible
  • L'échelle de synthèse souhaitée ainsi que les étiquettes 5'- et 3'-.